Rodzaje i metody termopunktury zmieniły się znacznie na przestrzeni wieków ze względu na gromadzone doświadczenie.
Podczas zabiegu termopunktury należy pilnować pozycji ciała pacjenta a także natężenia, kolejności
i czasu stosowania termopunktury. Pożądane działanie terapeutyczne w leczonych chorobach można osiągnąć jedynie, poprzez dokładne opanowanie technik termopunktury i staranne ich wykonywanie. Najczęściej stosowanymi metodami termopunktury jest stosowanie rolek moksy oraz termopunktura ciepłem.
Podczas zabiegów należy zadbać o bezpieczeństwo pacjenta i zapobiegać spadaniu popiołu z moksy na ciało, aby uniknąć poparzenia skóry.
Oprócz odpowiedniej pozycji ciała pacjenta należy przestrzegać określonej kolejności zabiegów, aby wzmocnić efekt terapii. Typowa kolejność wykonywania termopunktury, to najpierw górne części ciała, następnie dolne. Najpierw głowa a następnie cztery kończyny. Najpierw plecy a następnie klatka piersiowa i brzuch. Najpierw kanały Yang a następnie kanały Yin. Jednakże podczas wykonywania zabiegów termopunktury należy być elastycznym w wyborze kolejności w zależności od sytuacji i potrzeb.
Rozróżniamy kilka metod wykonywania zabiegu:
1. termopunktura łagodna,
2. termopunktura ruchem kolistym,
3. termopunktura „dziobanie”,
4. termopunktura dymem,
5. termopunktura parą wodną,
6. termopunktura z wykorzystaniem moksy „niebiańskiej”.